Hopfen produziert eine große Anzahl von Substanzen mit heilender, berauschender oder antiseptischer Wirkung. Außer α-Säuren, die als Indikatoren für die Hopfenqualität dienen, sind es mehr als 200 Arten von ätherischen Ölen, die ein typisches Hopfenaroma erzeugen, oder Flavonoide, dank derer hat Hopfen krebshemmende Eigenschaften.
Die meisten Pflanzen produzieren eine große Anzahl verschiedener Substanzen und Hopfen ist keine Ausnahme. Mit etwas Übertreibung konnte er mit einer spezialisierten Chemiefabrik verglichen werden. Aufgrund seiner spezifischen chemischen Zusammensetzung wurde Hopfen domestiziert und nicht nur für die Bierherstellung, sondern auch in der Medizin verwendet - beispielsweise zersetzen sich in Hopfen enthaltene α-Säuren nach dem Trinken von Bier in Substanzen, die beruhigend und leicht berauschend wirken (es ist kein Zufall, dass ein enger Verwandter von Hopfen der Hanf ist). Zufälligerweise sind dieselben Säuren eine der wesentlichen Komponenten, die den Geschmack von Bier beeinflussen, und ihr Anteil ist ein Maß für die Qualität der Ernte und die Bewertung der Hopfensorten. Ein weiteres wichtiges Produkt des Hopfenstoffwechsels sind ätherische Öle: Hopfen produziert Hunderte von Arten, und abgesehen vom Biergeschmack riecht der getrocknete Hopfen stark: Man kann leicht das Ende des Sommers in Žatec erkennen, der starke Geruch von Hopfen ist überall in der Landschaft zu spüren.
Wozu braucht Hopfen eigentlich, so viele energieintensive Wirkstoffe zu produzieren? Die Erklärung ist das Zusammenwachsen von Pflanzenfressern und Parasiten mit der Pflanze: Die meisten dieser Substanzen wirken als spezifische "Waffen" gegen Infektionen und Knabbereien und wirken daher häufig positiv und antiseptisch auf den menschlichen Körper.
Gleichzeitig werden diese ursprünglich defensiven Substanzen sehr häufig vom Menschen verwendet - aus einer anderen Pflanzenregion: z.B. im Paprika enthaltener Capsicin oder einer Vielzahl von sehr giftigen Alkaloiden mit Koffein an der Spitze.
Ähnliche Substanzen können auch dem aromatischen Geruch von Hopfenzapfen zugeschrieben werden: Der Hopfen enthält mehr als 200 Arten von aromatischen Ölen; Am auffälligsten sind Myrcin und Humulon - ihr charakteristischer Duft ist in der Landschaft schon während der Ernte von Hopfenzapfen zu spüren. Der hohe Gehalt an Flavonoiden wie Xanthohumol ist für die medizinische Industrie von Interesse, da er wahrscheinlich bestimmte Krebsarten hemmt.
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